Programmes

Mercuromix

Exploring the functional diversity and activity of microbial communities related to mercury cycling in Lake Geneva with new omics approaches

Mercury (chemical symbol Hg) is considered as a priority pollutant, including in Europe, mainly because of the toxicity of its organic form, methylmercury (MeHg), and its propensity to biomagnify, i.e. to increase its concentration in the tissues of organisms as it travels up the food chain. It is known that the Hg methylation, the transformation of divalent Hg (HgII) to MeHg, occurs under oxygen-free conditions and depends essentially on the activity of microorganisms characterized by specific genes – the hgcAB gene cluster. In addition, HgII methylation depends on the HgII bioavailability, the abundance of electron acceptors, the abundance and nature of organic matter as well as the activity and structure of the microbial community. It is therefore instrumental to understand the compendium of metabolic processes that can affect directly or indirectly HgII methylation. This project aims to determine and compare HgII-methylation, microbial biodiversity and activity involved in HgII methylation in contrasted physico-chemical contexts in Lake Geneva. We aim to overcome some of the current limits for predicting MeHg concentrations in the environment. This project will be a proof of concept of the interest of coupling cutting-edge high-throughput biological analysis (metagenomics and metaproteomics, i.e. global analysis of genes and proteins, respectively) with a physico-chemical characterization. An increased knowledge of the relationship between microbial community activity, physico-chemical conditions, MeHg production and demethylation is necessary to predict the variability in MeHg concentrations across environments and consequently mitigate the Hg methylation to protect environment and human health . ...
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POMELO

Plateforme multi-OMiques haut-dÉbit pour l’anaLyse du stress perturbateur endOcrinien chez le poisson

POMÉLO est un projet interdisciplinaire (biologie et médecine) et international (France-Canada-Belgique) de développement d’une méthodologie multi-omique associant séquençage à haut-débit et bio-informatique pour l’analyse du risque perturbateur endocrinien (PE) chez le poisson en contexte multistress. POMÉLO a pour objectif de confronter les résultats acquis par l’approche multi-omique aux réponses inflammatoires observées au niveau tissulaire. POMÉLO propose dans ce contexte de nouvelles méthodes d’échantillonnage de biopsies liquides non létales et de bancarisation sur carte FTA simple, peu coûteuse, n’exigeant aucune chaîne de froid ni de formation spécialisée. Afin d’améliorer les connaissances des effets sur la faune aquatique, des individus immatures de truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss; TAC), provenant de l’élevage fiabilisé de l’ANSES seront exposés au le tébuconazole (TBZ), un pesticide présumé PE et largement utilisé, à des doses environnementales en conditions chroniques. Afin de préciser cette évaluation du risque, les effets de l’exposition des truites au TBZ seront examinés sur la capacité des poissons contaminés à résister à un challenge viral à savoir une infection par le virus de la nécrose hématopoïétique infectieuse (vNHI). L’examen des effets du TBZ et de l’infection par le vNHI sur les marqueurs de perturbation endocrinienne, immunitaires, du stress oxydant et du métabolisme énergétique nous permettra d’évaluer les effets propres au virus et ceux associés aux expositions des poissons aux deux stress seuls et en combinaison. ...
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RedPol

Réduction de la pollution des perturbateurs endocriniens à la source : mise à disposition d'outils innovants

Le projet RedPol se concentre sur la question des perturbateurs endocriniens. Les perturbateurs endocriniens sont des substances chimiques qui peuvent interférer avec les systèmes endocriniens (ou hormonaux) à certaines doses et peuvent provoquer des tumeurs cancéreuses, des anomalies congénitales et d'autres troubles du développement chez les êtres humains. Cela a également un impact sur l'environnement au sens large, entraînant des problèmes de reproduction et d'infertilité chez la population d'animaux sauvages, ce qui peut générer un déséquilibre dans la répartition de la population entre les hommes et les femmes à la base de la chaîne alimentaire. ...
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SMoB

SMoB

Station Mobile de Biosurveillance. ...
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Biosurveillance

Proposition d’un pilote basé sur l’utilisation de biomarqueurs pour un appui à la surveillance de la qualité des masses d’eau du district Seine-Normandie

L’objectif principal du projet est de proposer un pilote, basé sur la méthodologie développée dans le projet SASHIMI (Surveillance active de l’impact de la pression chimique par des biomarqueurs- financement AFB), afin d’appuyer la surveillance des masses d’eau continentales, de transition et côtières sur le district Seine Normandie. De façon plus précise, le projet BIOSURVEILLANCE visera à i) valider l’utilisation des biomarqueurs comme appui à la surveillance par un déploiement à l’échelle des masses d’eau du district Seine Normandie, ii) construire une démarche visant à être pérennisée et transférable aux gestionnaires. ...
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DeMO

DeMO

Développement de biomarqueurs subcellaires liés au Métabolisme énergétique chez la Moule zébrée : cryofixation et paramètres structuraux des mitochondries ...
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EPIC

Utilisation de l’épinoche à trois épines pour étudier les effets d’un cocktail de pesticides issus de la riziculture en Camargue, en condition de salinité variable : influence des mécanismes de sélection rapide sur la réponse Écotoxicologique

Utilisation de l’épinoche à trois épines pour étudier les effets d’un cocktail de pesticides issus de la riziculture en Camargue, en condition de salinité variable : influence des mécanismes de sélection rapide sur la réponse Écotoxicologique ...
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INCIDENCE

INteractions et Communication chImique entre les Diatomées toxiquEs Pseudo-Nitzschia et les Consommateurs primaires planctoniquEs

Les diatomées du genre Pseudo-nitzschia sont des micro-algues faisant partie intégrante de la communauté phytoplanctonique dans de nombreux écosystèmes côtiers et estuaires du globe, dont la baie et l’estuaire de Seine. Au sein de ces écosystèmes, la synthèse d’une neurotoxine, l’acide domoïque, par l’algue Pseudo-nitzschia et son accumulation dans différents compartiments du réseau trophique engendrent des risques sanitaires importants, en particulier liés à la consommation de coquillages. Ces évènements toxiques ont ainsi un fort impact socio-économique, en particulier sur les filières de pêche à la coquille Saint-Jacques. La plupart des études ayant jusqu’à maintenant porté sur l’influence des facteurs abiotiques sur le développement et la toxicité des Pseudo-nitzschia, il n’existe aucune information, en baie de Seine, sur la contamination par l’acide domoïque dans les compartiments pélagiques autres que phytoplanctonique ou sur l’influence des interactions biotiques sur la production de toxine chez Pseudo-nitzschia. Pourtant, les interactions entre Pseudo-nitzschia et ses consommateurs primaires planctoniques sont des processus cruciaux à appréhender car ils influencent la production et le transfert de la toxine dans le réseau trophique pélagique et, à terme, son éventuelle bioaccumulation dans les niveaux trophiques supérieurs. Des travaux récents montrent, par exemple, une influence des interactions entre certaines espèces de copépodes et de Pseudo-nitzschia sur la production de toxine des algues et les taux de broutage des copépodes. Cependant, les espèces de Pseudo-nitzschia et de copépodes se développant en baie et estuaire de Seine n’ont pour l’instant fait l’objet d’aucune étude sur leurs interactions. Le projet INCIDENCE s’attache donc à explorer pour la première fois les interactions entre les diatomées toxiques se développant en baie et estuaire de Seine et leurs consommateurs primaires zooplanctoniques, permettant ainsi d’acquérir des connaissances inédites sur le transfert et l’accumulation de toxines dans le réseau trophique de ces écosystèmes. ...
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MAQUEREAU

MAQUEREAU

Exploration du lien pression impact en cours d'eau à l'aide des biomarqueurs / Mesure de biomarqueurs chez 3 espèces représentatives des hydrossytèmes du bassin Artois-Pocardie, visant à développer des approches/ méthodologies innovantes in situ ...
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OBERON

Elaborer des stratégies pour évaluer les PE agissant sur le métabolisme (obésogènes in silico/in vitro/in vivo)

The OBERON project aims to establish an integrated testing strategy (ITS) to detect endocrine disruptors-related metabolic disorders by developing, improving and validating a battery of test systems. It will be based on the concept of an integrated approach for testing and assessment (IATA) ...
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